كثرة تناول المكمل إلى تفاقم أعراض المناعة الذاتية يتميز تلك المرض من أمراض المناعة الذاتية بمهاجمة الخلايا السليمة التي تكون متواجدة في الجسم بشكل طبيعي فينتج عنها الإصابة بعدد من الأمراض كالبهاق والسكري و التهاب المفاصل والتصلب المتعدد والصدفية وفقر الدم ولذلك مكمل سبيرولينا مصدر إزعاج من مضاعفة نشاط الجهاز المناعي و تفاقم أعراض المناعة الذاتية ، غالبًا أيضا ما ينتج عن السبيروليا تركيز المعادن الثقيلة مثل الزئبق والكادميوم والزرنيخ والرصاص واستهلاكها كمكمل غذائي لفترة طويلة يؤشر بمؤشرات خطيرة لأجهزة الجسم الحشوية مثل الكبد والكلى كما أن الأطفال يكونوا أكثر عرضة للمضاعفات الخطيرة لتركيز المعادن بالجسم و تسبب الوفاة على أقل تقدير.


بجانب كل ذلك فإن المكمل معبأ بالفيتامينات والمعادن و ذلك يضر أكثر مما يفيد خاصة لمرضى الكلى هو خطر على وظائف الكلى لأنها تكون غير قادرة على طرد جميع المكونات غير الضرورية من مجرى الدم مما يتسبب في تراكم المواد الغذائية الزائدة يتسبب في تورم الأطراف وكما أنها تسبب الانزعاج للجهاز الهضمي استهلاكها المبالغ فيه يؤدي إلى تركيب الغازات بالجهاز الهضمي مما يسبب تشنجات البطن وانتفاخ البطن كما أنها تسبب مضاعفات خطيرة بالجهاز الهضمي كالغثيان و الجفاف الحاد ، ايضا تسبب تلك الطحالب الصدمات والتشنجات بسبب البكتيريا المنتجة للسموم التي تقوم بإصدارها داخل جسم الإنسان مما ينتج عن ذلك صدمة تلوث الدم المعروفة باسم الصدمة الانتانية خاصة لمن يعانون من الالتهاب الروماتويدي و ارتفاع ضغط الدم و التورم النخاعي